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研究进展
黑龙江水产研究所耐盐碱鱼类研究取得重要进展
时间:2013/06/18         点击率:

近日,由梁利群研究员主持的“鱼类耐盐碱研究”课题组采用罗氏454测序平台,分别完成了碱水、淡水雅罗鱼鳃、肾组织的转录组表达差异研究。

研究中测序共得到1,826,022条序列,其中有效序列1,683,616条,平均长度298bp。序列经Newbler软件拼接得到30,606contigs,平均长度为1,022bp。蛋白质数据库比对发现,19,196contigs具有明确的生物学功能,与斑马鱼匹配的同源蛋白多达16000条;数字差异表达谱分析显示,共有2247个基因在碱水、淡水雅罗鱼的鳃、肾组织中发生显著变化,其中在碱水中上调基因1049个,下调基因1198个。目前测序数据的初步分析、整理工作已接近尾声,数据深度挖掘工作正在有序进行中。

本项研究工作对揭示鱼类耐盐碱机理、培育性状优良的鱼类耐盐碱新品种,具有十分重要的科学意义。




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