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完成鲤鱼转录组数据采集和初步拼接分析
时间:2012/04/08         点击率:

中国水产科学研究院生物技术研究中心日前完成四种鲤鱼品系/品种的转录组数据的高通量采集,分别采集镜鲤、荷包红鲤、兴国红鲤、黄河鲤等的6种组织超过100 Gb的转录组序列。经过多轮转录组序列拼接,目前已经完成镜鲤转录组的初步组装,转录组N50长度接近1 kb,可以用于包括cSNP挖掘、表达谱分析、比较转录组分析等多种用途,而且该转录组拼接数据还将可以作为参考序列,完成对目前正在装配的鲤鱼基因组框架图的基因组注释,具有重要意义。目前镜鲤转录组的功能注释工作正在进行之中,待完成之后将在专项内部共享。


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