黑龙江水产研究所构建了鲤高密度SNP标记和微卫星标记整合图谱：采用镜鲤F1群体（107个体），1116个微卫星标记和4026个SNP标记，构建了两种标记的整合图谱，共构建了50个连锁群，连锁在图谱上的标记共4877个(978个微卫星标记，3899个SNP标记)，连锁群标记数介于32-166个，平均97.54个，总图4775.90CM，平均图距0.98cm.
通过QTL定位共获得体重、体长、全长、体高、体厚、头长、吻长、眼径、眼间距、尾柄长和尾柄高等11个主要生长性状QTL位点870个，除去重复位点数，11性状QTL位点数共计490个。其中解释表型变异超过20%的主效QTL位点32个，解释表型变异较大的QTL位点主要分布在第39连锁群和第45连锁群上。通过标记所在序列同鲤鱼全基因组装配图比较，在108个QTL区间共找到117个生长相关的功能基因。此外，通过单标记回归分析，还得到61个标记与上述性状显著相关。这些主效基因和紧密连锁的标记为镜鲤的分子育种奠定了基础。
初步构建了基于QTL标记的个体选择软件，此软件整合了ONEMAP连锁图谱分析软件的两点分析算法的精确性及MSTMap连锁图谱分析软件的高效性，能快速、准确的进行高通量标记数据的遗传连锁图谱分析。目前已对此软件的核心算法进行了代码编写及调试，下一步工作对其进行整合和测试工作。